Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccnd3P30282 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccnd3P30282 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccnd3P30282 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccnd3P30282 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccnd3P30282 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccnd3P30282 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccnd3P30282 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccnd3P30282 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccnd3P30282 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccnd3P30282 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccnd3P30282 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnd3P30282 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms