Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms