Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms