Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa5P28312 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa5P28312 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms