Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa2P28309 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa2P28309 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa2P28309 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa2P28309 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa2P28309 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms