Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afxP27661 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afxP27661 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afxP27661 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afxP27661 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afxP27661 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2afxP27661 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2afxP27661 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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