Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CftrP26361 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CftrP26361 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CftrP26361 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CftrP26361 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CftrP26361 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CftrP26361 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CftrP26361 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CftrP26361 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CftrP26361 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CftrP26361 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CftrP26361 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CftrP26361 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CftrP26361 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CftrP26361 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CftrP26361 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CftrP26361 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CftrP26361 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CftrP26361 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CftrP26361 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CftrP26361 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CftrP26361 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CftrP26361 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CftrP26361 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CftrP26361 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CftrP26361 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CftrP26361 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CftrP26361 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CftrP26361 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CftrP26361 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CftrP26361 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CftrP26361 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CftrP26361 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CftrP26361 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CftrP26361 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CftrP26361 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CftrP26361 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CftrP26361 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CftrP26361 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CftrP26361 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CftrP26361 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CftrP26361 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CftrP26361 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CftrP26361 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CftrP26361 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CftrP26361 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CftrP26361 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CftrP26361 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CftrP26361 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CftrP26361 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CftrP26361 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CftrP26361 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CftrP26361 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CftrP26361 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CftrP26361 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CftrP26361 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CftrP26361 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CftrP26361 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CftrP26361 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CftrP26361 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CftrP26361 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CftrP26361 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CftrP26361 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CftrP26361 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CftrP26361 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CftrP26361 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CftrP26361 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CftrP26361 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CftrP26361 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CftrP26361 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CftrP26361 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CftrP26361 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CftrP26361 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CftrP26361 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CftrP26361 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CftrP26361 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CftrP26361 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CftrP26361 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CftrP26361 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CftrP26361 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CftrP26361 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CftrP26361 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CftrP26361 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CftrP26361 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CftrP26361 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CftrP26361 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CftrP26361 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CftrP26361 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CftrP26361 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CftrP26361 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CftrP26361 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CftrP26361 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CftrP26361 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CftrP26361 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CftrP26361 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CftrP26361 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CftrP26361 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CftrP26361 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CftrP26361 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CftrP26361 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms