Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf239P24399 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf239P24399 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf239P24399 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf239P24399 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf239P24399 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms