Protein–RNA interactions for Protein: P23819

Gria2, Glutamate receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria2P23819 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria2P23819 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria2P23819 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria2P23819 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria2P23819 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria2P23819 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria2P23819 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gria2P23819 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gria2P23819 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms