Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gm28341-201ENSMUST00000190883 472 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 4933402J10Rik-202ENSMUST00000198882 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Serpinb6d-202ENSMUST00000221681 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gm10267-201ENSMUST00000091916 258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Olfr1101-201ENSMUST00000099870 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Akr1c20-201ENSMUST00000078239 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Olfr1037-203ENSMUST00000216020 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 1700015G11Rik-201ENSMUST00000180038 397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gm29588-201ENSMUST00000185738 298 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gm8826-201ENSMUST00000193161 948 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gm2077-201ENSMUST00000195017 319 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gm43232-201ENSMUST00000201346 364 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gm39154-201ENSMUST00000210257 560 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Il1f8-201ENSMUST00000028363 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gm28533-202ENSMUST00000190106 1346 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Klra17-202ENSMUST00000122219 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gm17061-201ENSMUST00000163167 499 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gm26626-201ENSMUST00000180989 713 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gm26870-201ENSMUST00000181242 1170 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Trav15d-3-201ENSMUST00000198604 167 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gm43659-201ENSMUST00000200894 628 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gm44712-201ENSMUST00000206250 1076 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gm31904-201ENSMUST00000219446 877 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 AC192333.2-201ENSMUST00000224771 196 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
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Hoxd11P23813 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Olfr641-201ENSMUST00000098183 939 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Olfr781-202ENSMUST00000204108 1304 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Olfr733-201ENSMUST00000163469 994 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gm21858-201ENSMUST00000177834 498 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gm43040-201ENSMUST00000202399 558 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 AC153897.1-201ENSMUST00000213510 470 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 AC118249.1-201ENSMUST00000224822 608 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 AC140451.1-201ENSMUST00000227984 737 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Skint2-201ENSMUST00000058791 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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