Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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