Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
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