Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms