Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klra1P20937 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klra1P20937 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klra1P20937 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Klra1P20937 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klra1P20937 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klra1P20937 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klra1P20937 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klra1P20937 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms