Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc2P20801 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms