Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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