Protein–RNA interactions for Protein: P20352

F3, Tissue factor, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F3P20352 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F3P20352 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F3P20352 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F3P20352 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F3P20352 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F3P20352 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F3P20352 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F3P20352 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F3P20352 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F3P20352 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F3P20352 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F3P20352 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F3P20352 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F3P20352 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F3P20352 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F3P20352 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
F3P20352 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F3P20352 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F3P20352 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F3P20352 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F3P20352 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F3P20352 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F3P20352 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F3P20352 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F3P20352 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F3P20352 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F3P20352 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
F3P20352 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
F3P20352 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F3P20352 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
F3P20352 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F3P20352 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F3P20352 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F3P20352 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F3P20352 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F3P20352 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F3P20352 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F3P20352 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
F3P20352 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
F3P20352 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F3P20352 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F3P20352 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F3P20352 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F3P20352 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
F3P20352 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
F3P20352 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
F3P20352 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
F3P20352 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F3P20352 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F3P20352 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F3P20352 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
F3P20352 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
F3P20352 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
F3P20352 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
F3P20352 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
F3P20352 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
F3P20352 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
F3P20352 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
F3P20352 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
F3P20352 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
F3P20352 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
F3P20352 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
F3P20352 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
F3P20352 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
F3P20352 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F3P20352 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F3P20352 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F3P20352 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F3P20352 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F3P20352 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F3P20352 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F3P20352 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F3P20352 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F3P20352 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F3P20352 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
F3P20352 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F3P20352 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F3P20352 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F3P20352 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F3P20352 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F3P20352 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F3P20352 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F3P20352 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F3P20352 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F3P20352 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F3P20352 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F3P20352 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F3P20352 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F3P20352 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F3P20352 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F3P20352 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F3P20352 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F3P20352 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F3P20352 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F3P20352 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F3P20352 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F3P20352 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F3P20352 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F3P20352 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F3P20352 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms