Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms