Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P20040 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P20040 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P20040 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P20040 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P20040 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P20040 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P20040 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P20040 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P20040 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P20040 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P20040 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P20040 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P20040 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P20040 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P20040 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P20040 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P20040 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P20040 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P20040 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P20040 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P20040 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P20040 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
P20040 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P20040 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P20040 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
P20040 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P20040 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P20040 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P20040 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P20040 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P20040 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P20040 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P20040 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P20040 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P20040 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P20040 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P20040 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P20040 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P20040 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P20040 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P20040 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P20040 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
P20040 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P20040 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P20040 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P20040 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P20040 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P20040 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
P20040 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P20040 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
P20040 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P20040 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P20040 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P20040 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P20040 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P20040 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
P20040 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P20040 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P20040 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P20040 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P20040 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P20040 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P20040 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P20040 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P20040 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P20040 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P20040 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P20040 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P20040 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P20040 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P20040 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P20040 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P20040 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P20040 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P20040 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P20040 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P20040 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P20040 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P20040 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P20040 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P20040 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P20040 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P20040 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P20040 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
P20040 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P20040 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
P20040 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P20040 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P20040 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P20040 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P20040 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P20040 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P20040 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P20040 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P20040 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P20040 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P20040 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P20040 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P20040 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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