Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms