Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NefhP19246 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NefhP19246 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NefhP19246 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NefhP19246 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NefhP19246 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NefhP19246 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NefhP19246 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NefhP19246 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NefhP19246 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NefhP19246 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NefhP19246 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NefhP19246 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NefhP19246 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NefhP19246 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NefhP19246 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NefhP19246 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NefhP19246 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NefhP19246 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NefhP19246 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NefhP19246 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NefhP19246 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NefhP19246 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NefhP19246 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NefhP19246 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NefhP19246 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NefhP19246 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NefhP19246 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NefhP19246 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NefhP19246 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NefhP19246 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NefhP19246 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NefhP19246 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NefhP19246 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NefhP19246 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NefhP19246 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NefhP19246 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NefhP19246 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NefhP19246 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NefhP19246 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NefhP19246 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NefhP19246 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NefhP19246 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NefhP19246 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NefhP19246 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NefhP19246 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NefhP19246 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NefhP19246 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NefhP19246 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NefhP19246 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NefhP19246 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NefhP19246 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NefhP19246 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NefhP19246 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NefhP19246 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NefhP19246 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NefhP19246 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NefhP19246 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NefhP19246 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NefhP19246 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NefhP19246 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NefhP19246 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NefhP19246 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NefhP19246 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NefhP19246 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NefhP19246 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NefhP19246 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NefhP19246 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NefhP19246 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NefhP19246 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NefhP19246 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NefhP19246 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NefhP19246 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NefhP19246 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NefhP19246 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NefhP19246 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NefhP19246 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NefhP19246 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NefhP19246 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NefhP19246 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NefhP19246 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NefhP19246 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NefhP19246 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NefhP19246 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NefhP19246 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NefhP19246 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NefhP19246 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NefhP19246 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NefhP19246 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NefhP19246 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NefhP19246 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NefhP19246 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NefhP19246 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NefhP19246 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NefhP19246 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NefhP19246 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NefhP19246 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NefhP19246 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NefhP19246 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NefhP19246 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms