Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms