Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18532 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
P18532 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
P18532 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18532 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18532 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18532 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18532 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
P18532 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18532 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18532 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18532 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18532 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18532 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18532 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18532 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
P18532 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
P18532 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
P18532 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
P18532 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
P18532 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
P18532 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
P18532 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18532 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18532 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18532 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
P18532 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
P18532 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
P18532 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18532 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18532 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
P18532 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
P18532 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
P18532 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18532 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18532 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18532 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18532 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18532 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18532 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18532 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18532 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18532 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18532 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18532 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18532 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18532 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18532 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18532 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18532 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18532 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
P18532 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18532 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
P18532 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18532 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18532 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18532 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18532 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18532 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18532 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18532 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18532 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18532 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18532 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18532 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
P18532 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18532 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18532 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18532 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18532 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18532 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18532 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18532 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18532 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18532 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18532 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18532 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18532 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18532 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18532 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18532 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18532 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18532 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18532 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18532 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18532 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18532 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18532 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18532 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18532 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18532 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18532 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18532 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18532 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18532 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18532 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
P18532 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
P18532 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
P18532 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18532 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms