Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcnaP17918 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PcnaP17918 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcnaP17918 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcnaP17918 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcnaP17918 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcnaP17918 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcnaP17918 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PcnaP17918 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PcnaP17918 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PcnaP17918 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PcnaP17918 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PcnaP17918 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PcnaP17918 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PcnaP17918 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PcnaP17918 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PcnaP17918 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PcnaP17918 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PcnaP17918 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PcnaP17918 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PcnaP17918 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PcnaP17918 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PcnaP17918 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PcnaP17918 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PcnaP17918 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PcnaP17918 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PcnaP17918 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PcnaP17918 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PcnaP17918 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PcnaP17918 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PcnaP17918 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PcnaP17918 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PcnaP17918 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PcnaP17918 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PcnaP17918 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PcnaP17918 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PcnaP17918 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PcnaP17918 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PcnaP17918 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PcnaP17918 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PcnaP17918 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms