Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms