Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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