Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms