Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhoP15409 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhoP15409 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhoP15409 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RhoP15409 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhoP15409 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhoP15409 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhoP15409 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhoP15409 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhoP15409 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhoP15409 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhoP15409 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhoP15409 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhoP15409 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhoP15409 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhoP15409 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhoP15409 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhoP15409 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhoP15409 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhoP15409 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhoP15409 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RhoP15409 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhoP15409 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RhoP15409 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhoP15409 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhoP15409 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhoP15409 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhoP15409 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhoP15409 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RhoP15409 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhoP15409 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhoP15409 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhoP15409 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhoP15409 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhoP15409 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhoP15409 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhoP15409 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhoP15409 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhoP15409 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhoP15409 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhoP15409 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhoP15409 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RhoP15409 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhoP15409 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhoP15409 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhoP15409 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhoP15409 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RhoP15409 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RhoP15409 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhoP15409 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RhoP15409 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhoP15409 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RhoP15409 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhoP15409 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhoP15409 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhoP15409 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhoP15409 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhoP15409 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhoP15409 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhoP15409 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhoP15409 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhoP15409 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhoP15409 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhoP15409 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhoP15409 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhoP15409 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhoP15409 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhoP15409 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhoP15409 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhoP15409 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhoP15409 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhoP15409 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhoP15409 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhoP15409 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhoP15409 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhoP15409 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhoP15409 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RhoP15409 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhoP15409 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhoP15409 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhoP15409 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhoP15409 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RhoP15409 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhoP15409 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhoP15409 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhoP15409 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RhoP15409 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RhoP15409 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhoP15409 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhoP15409 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhoP15409 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RhoP15409 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhoP15409 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhoP15409 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhoP15409 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhoP15409 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhoP15409 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhoP15409 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhoP15409 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhoP15409 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms