Protein–RNA interactions for Protein: P14576

Srp54, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54P14576 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp54P14576 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp54P14576 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp54P14576 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Srp54P14576 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54P14576 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54P14576 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54P14576 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp54P14576 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp54P14576 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms