Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC9.84□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms