Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DmdP11531 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DmdP11531 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DmdP11531 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DmdP11531 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DmdP11531 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DmdP11531 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DmdP11531 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DmdP11531 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DmdP11531 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DmdP11531 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DmdP11531 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DmdP11531 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DmdP11531 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DmdP11531 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DmdP11531 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DmdP11531 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DmdP11531 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DmdP11531 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DmdP11531 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DmdP11531 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DmdP11531 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DmdP11531 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DmdP11531 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DmdP11531 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DmdP11531 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DmdP11531 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DmdP11531 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DmdP11531 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DmdP11531 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
DmdP11531 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
DmdP11531 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DmdP11531 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DmdP11531 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
DmdP11531 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DmdP11531 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
DmdP11531 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DmdP11531 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DmdP11531 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DmdP11531 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DmdP11531 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DmdP11531 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DmdP11531 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DmdP11531 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DmdP11531 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DmdP11531 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DmdP11531 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DmdP11531 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DmdP11531 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
DmdP11531 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
DmdP11531 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DmdP11531 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DmdP11531 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DmdP11531 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DmdP11531 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DmdP11531 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DmdP11531 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DmdP11531 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DmdP11531 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DmdP11531 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DmdP11531 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DmdP11531 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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DmdP11531 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DmdP11531 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DmdP11531 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DmdP11531 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DmdP11531 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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DmdP11531 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
DmdP11531 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
DmdP11531 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
DmdP11531 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
DmdP11531 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
DmdP11531 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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DmdP11531 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
DmdP11531 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
DmdP11531 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
DmdP11531 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
DmdP11531 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
DmdP11531 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
DmdP11531 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DmdP11531 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DmdP11531 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DmdP11531 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DmdP11531 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DmdP11531 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DmdP11531 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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