Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prf1P10820 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prf1P10820 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prf1P10820 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prf1P10820 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prf1P10820 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prf1P10820 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prf1P10820 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prf1P10820 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prf1P10820 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prf1P10820 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prf1P10820 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prf1P10820 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms