Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

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Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a2P08122 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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