Protein–RNA interactions for Protein: P06339

H2-T23, H-2 class I histocompatibility antigen, D-37 alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-T23P06339 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-T23P06339 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms