Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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PdgfrbP05622 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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PdgfrbP05622 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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PdgfrbP05622 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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