Protein–RNA interactions for Protein: P01671

Ig kappa chain V-III region PC 7175, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01671 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
P01671 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01671 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01671 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01671 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01671 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01671 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01671 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01671 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
P01671 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01671 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01671 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01671 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01671 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01671 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01671 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01671 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01671 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01671 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01671 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01671 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01671 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01671 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P01671 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01671 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
P01671 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01671 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01671 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01671 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01671 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
P01671 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01671 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01671 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01671 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P01671 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01671 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01671 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01671 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01671 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01671 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01671 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01671 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01671 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01671 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01671 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01671 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01671 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01671 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01671 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01671 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01671 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01671 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
P01671 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01671 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01671 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01671 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01671 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01671 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01671 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
P01671 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01671 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01671 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01671 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01671 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01671 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
P01671 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01671 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01671 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01671 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01671 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01671 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01671 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01671 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01671 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01671 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01671 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01671 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01671 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01671 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01671 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01671 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01671 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01671 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01671 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01671 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01671 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01671 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01671 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01671 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01671 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01671 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01671 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01671 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01671 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01671 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01671 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01671 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
P01671 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01671 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01671 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms