Protein–RNA interactions for Protein: P01647

Ig kappa chain V-V region HP 124E1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01647 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01647 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01647 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01647 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01647 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
P01647 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01647 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01647 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01647 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01647 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01647 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01647 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01647 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01647 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01647 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01647 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01647 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01647 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01647 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01647 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01647 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01647 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01647 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01647 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01647 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01647 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01647 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01647 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01647 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01647 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01647 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01647 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01647 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01647 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01647 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01647 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01647 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01647 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01647 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01647 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01647 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01647 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01647 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01647 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01647 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01647 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01647 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01647 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01647 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01647 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01647 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01647 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01647 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01647 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01647 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01647 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01647 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01647 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01647 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01647 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01647 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01647 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01647 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01647 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01647 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01647 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01647 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01647 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01647 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01647 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01647 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01647 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01647 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01647 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01647 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01647 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01647 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01647 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01647 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01647 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01647 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01647 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01647 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01647 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01647 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01647 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01647 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01647 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01647 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01647 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01647 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01647 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01647 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01647 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01647 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01647 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01647 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01647 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01647 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01647 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms