Protein–RNA interactions for Protein: O89116

Vti1a, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1aO89116 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Vti1aO89116 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Vti1aO89116 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Vti1aO89116 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vti1aO89116 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms