Protein–RNA interactions for Protein: O89104

Sypl2, Synaptophysin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl2O89104 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sypl2O89104 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms