Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Ccl20O89093 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Ccl20O89093 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Ccl20O89093 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Ccl20O89093 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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