Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JtbO88824 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
JtbO88824 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JtbO88824 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JtbO88824 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JtbO88824 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
JtbO88824 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
JtbO88824 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
JtbO88824 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
JtbO88824 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
JtbO88824 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
JtbO88824 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
JtbO88824 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
JtbO88824 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
JtbO88824 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
JtbO88824 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
JtbO88824 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
JtbO88824 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
JtbO88824 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
JtbO88824 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
JtbO88824 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
JtbO88824 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
JtbO88824 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
JtbO88824 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
JtbO88824 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
JtbO88824 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
JtbO88824 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
JtbO88824 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
JtbO88824 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
JtbO88824 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
JtbO88824 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
JtbO88824 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
JtbO88824 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
JtbO88824 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
JtbO88824 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
JtbO88824 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
JtbO88824 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
JtbO88824 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
JtbO88824 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
JtbO88824 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
JtbO88824 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
JtbO88824 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
JtbO88824 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
JtbO88824 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
JtbO88824 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
JtbO88824 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
JtbO88824 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
JtbO88824 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
JtbO88824 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
JtbO88824 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
JtbO88824 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
JtbO88824 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
JtbO88824 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
JtbO88824 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
JtbO88824 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
JtbO88824 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
JtbO88824 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
JtbO88824 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
JtbO88824 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
JtbO88824 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
JtbO88824 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
JtbO88824 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
JtbO88824 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
JtbO88824 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
JtbO88824 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
JtbO88824 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
JtbO88824 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
JtbO88824 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
JtbO88824 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
JtbO88824 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
JtbO88824 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
JtbO88824 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
JtbO88824 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
JtbO88824 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
JtbO88824 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
JtbO88824 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
JtbO88824 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
JtbO88824 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
JtbO88824 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
JtbO88824 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
JtbO88824 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
JtbO88824 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
JtbO88824 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
JtbO88824 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
JtbO88824 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
JtbO88824 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
JtbO88824 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
JtbO88824 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
JtbO88824 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
JtbO88824 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
JtbO88824 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
JtbO88824 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
JtbO88824 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
JtbO88824 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
JtbO88824 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
JtbO88824 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
JtbO88824 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
JtbO88824 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
JtbO88824 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
JtbO88824 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms