Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

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Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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Hcn2O88703 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Hcn2O88703 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Hcn2O88703 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Hcn2O88703 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Hcn2O88703 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Hcn2O88703 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Hcn2O88703 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Hcn2O88703 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Hcn2O88703 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Hcn2O88703 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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Hcn2O88703 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcn2O88703 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Hcn2O88703 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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