Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BlmO88700 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BlmO88700 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BlmO88700 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BlmO88700 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BlmO88700 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BlmO88700 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BlmO88700 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BlmO88700 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BlmO88700 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BlmO88700 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BlmO88700 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BlmO88700 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BlmO88700 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BlmO88700 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BlmO88700 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BlmO88700 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BlmO88700 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BlmO88700 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BlmO88700 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BlmO88700 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BlmO88700 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BlmO88700 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BlmO88700 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BlmO88700 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BlmO88700 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BlmO88700 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BlmO88700 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BlmO88700 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BlmO88700 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BlmO88700 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
BlmO88700 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.31
BlmO88700 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
BlmO88700 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
BlmO88700 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BlmO88700 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BlmO88700 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BlmO88700 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BlmO88700 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BlmO88700 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BlmO88700 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BlmO88700 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BlmO88700 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BlmO88700 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BlmO88700 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BlmO88700 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BlmO88700 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BlmO88700 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BlmO88700 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BlmO88700 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BlmO88700 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BlmO88700 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BlmO88700 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BlmO88700 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BlmO88700 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BlmO88700 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BlmO88700 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BlmO88700 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BlmO88700 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BlmO88700 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BlmO88700 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BlmO88700 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BlmO88700 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BlmO88700 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BlmO88700 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BlmO88700 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BlmO88700 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BlmO88700 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BlmO88700 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
BlmO88700 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BlmO88700 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BlmO88700 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BlmO88700 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BlmO88700 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BlmO88700 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BlmO88700 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BlmO88700 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BlmO88700 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
BlmO88700 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BlmO88700 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BlmO88700 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BlmO88700 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BlmO88700 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BlmO88700 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BlmO88700 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BlmO88700 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BlmO88700 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BlmO88700 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BlmO88700 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BlmO88700 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BlmO88700 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BlmO88700 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BlmO88700 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BlmO88700 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BlmO88700 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BlmO88700 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BlmO88700 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BlmO88700 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BlmO88700 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BlmO88700 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms