Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cops6O88545 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Cops6O88545 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cops6O88545 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cops6O88545 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
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Cops6O88545 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cops6O88545 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cops6O88545 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Cops6O88545 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cops6O88545 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Cops6O88545 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cops6O88545 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cops6O88545 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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