Protein–RNA interactions for Protein: O88451

Rdh7, Retinol dehydrogenase 7, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh7O88451 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Rdh7O88451 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rdh7O88451 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rdh7O88451 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rdh7O88451 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rdh7O88451 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rdh7O88451 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rdh7O88451 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rdh7O88451 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rdh7O88451 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rdh7O88451 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rdh7O88451 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rdh7O88451 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rdh7O88451 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rdh7O88451 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rdh7O88451 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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