Protein–RNA interactions for Protein: O88430

Ccl22, C-C motif chemokine 22, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl22O88430 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl22O88430 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl22O88430 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl22O88430 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl22O88430 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl22O88430 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl22O88430 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl22O88430 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl22O88430 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl22O88430 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl22O88430 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl22O88430 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl22O88430 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl22O88430 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl22O88430 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl22O88430 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl22O88430 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccl22O88430 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccl22O88430 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccl22O88430 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccl22O88430 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl22O88430 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms