Protein–RNA interactions for Protein: O70507

Hcn4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn4O70507 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hcn4O70507 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hcn4O70507 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hcn4O70507 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hcn4O70507 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hcn4O70507 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hcn4O70507 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hcn4O70507 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hcn4O70507 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hcn4O70507 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hcn4O70507 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hcn4O70507 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hcn4O70507 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hcn4O70507 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hcn4O70507 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hcn4O70507 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hcn4O70507 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hcn4O70507 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hcn4O70507 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hcn4O70507 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hcn4O70507 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hcn4O70507 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hcn4O70507 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hcn4O70507 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hcn4O70507 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hcn4O70507 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hcn4O70507 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hcn4O70507 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hcn4O70507 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hcn4O70507 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hcn4O70507 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hcn4O70507 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hcn4O70507 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hcn4O70507 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hcn4O70507 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hcn4O70507 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hcn4O70507 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hcn4O70507 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hcn4O70507 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hcn4O70507 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hcn4O70507 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hcn4O70507 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hcn4O70507 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hcn4O70507 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms