Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stra6O70491 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stra6O70491 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stra6O70491 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stra6O70491 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stra6O70491 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stra6O70491 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stra6O70491 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stra6O70491 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stra6O70491 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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