Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtssO70370 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtssO70370 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtssO70370 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtssO70370 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtssO70370 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtssO70370 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtssO70370 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtssO70370 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtssO70370 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtssO70370 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtssO70370 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtssO70370 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtssO70370 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtssO70370 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtssO70370 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtssO70370 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtssO70370 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtssO70370 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtssO70370 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtssO70370 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtssO70370 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtssO70370 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtssO70370 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtssO70370 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtssO70370 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtssO70370 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtssO70370 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtssO70370 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtssO70370 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtssO70370 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtssO70370 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtssO70370 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtssO70370 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtssO70370 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtssO70370 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtssO70370 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CtssO70370 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtssO70370 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtssO70370 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtssO70370 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtssO70370 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CtssO70370 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtssO70370 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtssO70370 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtssO70370 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtssO70370 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtssO70370 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtssO70370 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtssO70370 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtssO70370 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtssO70370 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtssO70370 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtssO70370 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtssO70370 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtssO70370 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CtssO70370 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtssO70370 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtssO70370 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtssO70370 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtssO70370 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtssO70370 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtssO70370 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtssO70370 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtssO70370 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtssO70370 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtssO70370 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtssO70370 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtssO70370 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtssO70370 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtssO70370 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtssO70370 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtssO70370 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtssO70370 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtssO70370 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtssO70370 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtssO70370 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtssO70370 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtssO70370 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CtssO70370 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtssO70370 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtssO70370 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtssO70370 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtssO70370 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtssO70370 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtssO70370 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtssO70370 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtssO70370 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtssO70370 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtssO70370 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CtssO70370 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CtssO70370 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtssO70370 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtssO70370 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtssO70370 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtssO70370 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtssO70370 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtssO70370 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtssO70370 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtssO70370 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms