Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms